ggplot2 3.0.0以降はviridisによる色付けが標準機能に取り込まれ、になった模様。 ggplot2 3.0.0 - Tidyverse

Viridis colour scales from viridisLite — scale_colour_viridis_d • ggplot2

ggsci

ggsci 学術雑誌で使われるような色合いのパレットを提供してくれるパッケージ。 +ggpubrでlancetをよく用いている。 +ggplot2 で用いる場合は以下のようにscale_color_palnameとscale_fill_palnameを追加する。

library(ggsci)
data %>%
  ggplot(aes(x, y), color = color, fill = fill) +
  geom_point() +
  scale_color_lancet() +
  scale_fill_lancet()

Scientific Journal and Sci-Fi Themed Color Palettes for ggplot2

マニュアルで色指定をしなくてはいけない時用に。 ggsci/data-generator.R at master · road2stat/ggsci

# Color palette inspired by plots in Lancet Oncology
ggsci_db$'lancet'$'lanonc' = c(
  'CongressBlue' = '#00468B', 'Red'       = '#ED0000',
  'Apple'        = '#42B540', 'BondiBlue' = '#0099B4',
  'TrendyPink'   = '#925E9F', 'MonaLisa'  = '#FDAF91',
  'Carmine'      = '#AD002A', 'Edward'    = '#ADB6B6',
  'CodGray'      = '#1B1919')